logo

logo

市场活动

Market activity

产品促销

Product promotion

华大BGISEQ测序第15次登上Nat Comm!

继《Nature》、《Cell》和三篇《Immunity》之后,华大BGISEQ平台测序产品在连续打卡大牌期刊的大道上一路狂奔。7月还未过半,《Nature Communications》上BGISEQ测序文章就已经连发两篇,累积发表15篇(后附详细文章列表)。其中7月2日这篇,仅采用了4个样本,BGISEQ RNA-Seq一种测序技术,下面科技君带大家一起深入了解这篇文章。

1

文章题目:《Fas signaling-mediated TH9 cell differentiation favors bowel inflammation and antitumor functions》

发表期刊:《Nature Communications》

发表时间:2019年7月2日

影响因子:11.878

研究单位:浙江大学医学院等

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-019-10889-4


测序技术:BGISEQ RNA-Seq


研究概述:

研究揭示了Fas蛋白在调控TH9细胞分化及炎症、抗肿瘤中的关键调控作用。


研究背景:

肿瘤免疫治疗无疑是时下最热点的科研方向之一。T细胞治疗是诸多肿瘤免疫治疗类型中最强有力的方案之一。早期研究多以CD8+ T细胞为主,而CD4+ T细胞介导的免疫疗法较少。白介素9分泌型CD4+ T细胞(TH9)是一群新发现的具有抗肿瘤作用的T细胞亚群。


Fas和Fas配体FasL(Fas-ligand)是典型的肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)受体和TNF配体超家族成员。Fas信号通路除了介导T细胞凋亡,还可以参与T细胞的增殖和活化。Fas是否参与了TH9细胞的分化调控,尚不完全清楚。


研究结果:

1. Fas促进TH9细胞分化。

利用Fas及FasL缺失小鼠,结果发现Fas及FasL敲除后小鼠的TH9细胞分化水平明显降低。


2. Fas激活与TH9细胞功能相关的基因。

利用BGISEQ-500 RNA-Seq,进一步了解Fas在TH9细胞进程中作用。分析WT-TH9和Faslpr-TH动漫做爱9小鼠基因差异表达情况。


测序得到Faslpr-TH9小鼠相比于对照有204个差异表达基因,其中84个上调表达基因,120个下调表达基因(图1a)。Il9 是下调程度最高基因之一(图1a)。Gzm基因已有报道证明在9细胞中表达增强,有助于增强9细胞抗肿瘤活性。本研究中Gzma,Gzmc,Gzmd,Gzme Gzmg 表达下调,但是主要的颗粒酶调控基因Eomes Gzmk 表达上调(图1a),这些基因表达情况都通过qRT-PCR得到证实(图1b),这些结果说明,TH9细胞颗粒酶不依赖Eomes 调控。


聚类热图显示WT-TH9和Faslpr-TH9小鼠聚在相同的簇中,显示基因表达重合(图1c)。而且TH1细胞、TH2细胞、TH17细胞和调节性T细胞(Treg)相关基因在两组中没有显著差异(图1d)。这些结果表明,Fas缺失并不能从全局上影响TH9细胞分化。


TH动漫做爱9细胞在自身免疫病进程中起到关键作用。差异表达基因代谢通路富集分析,显示甲状腺病、I型糖尿病、系统性红斑狼疮等自身免疫病相关基因下调表达(图1d)。


所以RNA-Seq分析显示Fas参与TH9细胞基因的激活,负责TH9细胞的特定功能。

2

图1 Fas激活与TH9细胞功能相关的基因


3. Fas调控TH9细胞分化的机制模型。

进一步的机制探讨显示,Fas通过Ca2+依赖性PKC-β激活NF-κB从而促进TH9细胞分化。此外,PKC-β通过上调p38磷酸化水平使NFAT1失活,抑制NFAT1-NF-κB协同促进TH9细胞分化水平,起到负反馈调控作用(图2)。

3

图2 Fas调控TH9细胞分化的机制模型


4. Fas调控TH9细胞分化,在炎症、抗肿瘤中的关键调控作用。

Fas通过促进TH9细胞分化加重肠炎,Fas联合p38抑制剂明显提高TH9细胞的抗肿瘤能力。低剂量的p38抑制剂抑制肿瘤生长且无全身副作用。TH动漫做爱9细胞水平高的临床非小细胞肺癌病人预后较好。


研究结论:

本项研究揭示了Fas非凋亡信号调控的TH动漫做爱9细胞在自身免疫性疾病及肿瘤治疗中的作用,对改进自身免疫性疾病及肿瘤免疫治疗提供了新的可能性。


BGISEQ凭实力霸屏大牌期刊,更有RNA-Seq和真核转录组极速交付助您发文抢先一步!



重 磅 推 荐

极速交付

BGISEQ RNA-Seq和真核转录组,

开启极速交付新时代!

不用等提取!

不用等检测!

提取检测为起始,有参无参都极致!

动漫做爱RNA-Seq 11天,

真核转录组resequencing 14天,

真核转录组de novo 18天!

以上都是打包服务,包含检测!

RNA提取2天!


服务内容:动漫做爱RNA-Seq和真核转录组≤24个样本,检测+常规建库+BGISEQ平台SE50 /PE150测序+标准分析+Dr.Tom;提取总RNA≤48个样本。

详情请咨询当地科技代表。


BGISEQ平台测序产品在《Nature Communications》发表文章列表

4

* 订阅生命科学领域资讯及更多关于BGI的信息请点击


var _hmt = _hmt || []; (function() { var hm = document.createElement("script"); hm.src = "https://hm.baidu.com/hm.js?44d5929b98ed1fd093ffc3d47ec712b9"; var s = document.getElementsByTagName("script")[0]; s.parentNode.insertBefore(hm, s); })();